No, el upgrade se va a realizar cuando corras el UPGRADE de PL10.
Te preguntaras que caso tiene instalar la base PL5 sino migra tu BD. Es algo que en mi experiencia lo hago debido a que es la instalacion BASE de la version. Sino hubiese otra PL despues de la 5, ejecutarias el UPGRADER de PL5, pero como tu quieres brincarte a una PL supieror y que si existe entonces corres el UPGRADER de esa PL y ahi es donde MIGRAS tu BD.
Tienes que tener en cuneta que en cualquier version hay INSTALADORES y UPGRADERS.
Lo de la INTERCALACION es un tema muy importante, ya que SAP recomienda usar SQL_Latin1_General_CP1_CI_AS, si tu SQL no esta configurado de esa forma "YO EN LO PERSONAL"te recomiendo desisntales tu SQL y vuelvas a instalarlo con esta configuracion.
Existen métodos para cambiarlo con comandos, pero siempre me a gustado hacerlo todo en orden y de manera limpia, es por ello que lo hago desinstalando e instalar de nuevo.
En que influye esta intercalación, esto influye en el manejo de la BD por la aplicación SAP y en la creación de objetos y escritura en tu BD.